verbos de pensamiento y de percepción

Estoy revisando el tema de los verbos de pensamiento y percepción. En los libros se indica que cuando aparecen en frases afirmativas se usan seguidos de verbos en el indicativo. Si aparecen en frases negativas se debe utilizar el subjuntivo.Por ejemplo: Veo que estás muy bien. No veo que estés muy bien.Sin embargo, los libros dicen que hay excepciones a estas reglas pero no mencionan cuáles serían. Me podrían explicarlas? Gracias.