Concordancia en singular o plural

Ambas son correctas, pero la segunda forma podría resultar ambigua, ya que mientras que de El alma de los perros se entiende que cada perro tiene alma, de Las almas de los perros además de entenderse que es el plural de la frase anterior, podría percibirse que cada perro tuviera varias almas. En este último caso, el contexto en que se use debería aclarar el sentido.