Duda sobre respuesta recibida sobre «Coma y circunstancial anticipado»

Leyendo su respuesta a mi consulta sobre «Coma y circunstancial anticipado», ustedes afirman:"...R: La normativa no prescribe, pero sí recomienda colocar coma cuando el circunstancial de tiempo o de lugar es extenso o más que informar sobre la acción enmarca el enunciado...Note que los incisos no se colocan entre comillas. Las comillas sirven para resaltar una palabra por su significado..."Dudas que me surgieron de la lectura: ¿Solo es aplicable a los circunstanciales de tiempo o lugar, o puede darse con otro tipo de circunstanciales?, y con respecto al comentario del entrecomillado, si digo «Juan, a pesar de que recién salió del hospital, vino muy temprano» ¿no es el caso de un inciso entrecomillado? Gracias de antemano